山东中医药大学，位于山东省济南市。是山东省属全日制普通本科院校。学校前身是年创办的山东中医学院，年升级为山东中医药大学。年获得博士学位授予权。年设立首个博士后科研流动站。
曲阜师范大学，位于山东省曲阜市。是山东省重点大学。学校始建于年，时名山东师范专科学校。年升级为曲阜师范学院，同年9月由济南市迁址曲阜。年，学校被山东省人民政府确立为重点建设的六所高校之一。年升级为曲阜师范大学。
山东中医药大学是山东省中医类最高学府，而曲阜师范大学是山东省内第二师范大学。两校比较建校之初的班底实力的话，可以说旗鼓相当，都是本科院校起步的高校。但是在后期发展的过程中，曲阜师范大学要比山东中医药大学更快一些。这主要是因为虽然我国经济的发展，但是医疗卫生方面大力提倡西医，知识中医的教研和教学滞后，而且投入不足，医院校发展受限，所以山东中医药大学发展相对曲阜师范大学缓慢一些。
根据教育部近期的学科评估来看，曲阜师范大学有7个B类学科，6个C类学科，其中最高评级为B级的体育学；山东中医药大学有1个B类学科，3个C类学科，其中最高评级为B级的中医学。相对来看曲阜师范大学的学科建设更好一些。
综合来看，曲阜师范大学的实力要略高于山东中医药大学一些。